En la actualidad, el Atlas presenta nuevos productos y servicios acordes con los avances tecnológicos del siglo XXI, como son las nuevas ediciones electrónicas de los grupos temáticos en formato PDF y soporte CD/DVD, de los que están publicados veintidós.
La segunda edición de Transporte por Carretera y la tercera edición de Problemas Medioambientales son las últimas actualizaciones llevadas a cabo en el Atlas Nacional de España.

En Transporte por Carretera se describen materias tales como las historia de los caminos y las carreteras en España; los diferentes planes de carreteras hasta el Plan Estratégico de Infraestructuras y Transportes  2005-2020; la red de espacios naturales Natura 2000 y la red de gran capacidad previstas para  el año 2010; la red viaria española en el contexto europeo de la Red de Carreteras del Estado y de las Comunidades Autónomas y Diputaciones (autopistas, autovías y red convencional de primer orden).

En Problemas Medioambientales se abordan el cambio climático, la contaminación acústica, las principales clases de ocupación del suelo, los vertidos incontrolados de hidrocarburos, las energías renovables y el desarrollo sostenible.